Krivičnu prijavu protiv njega podnio je glavni inspektor Federalne uprave policije Ibro Bešlija iz Sarajeva, objavili su federalni mediji. 

U krivičnoj prijavi navodi se da je Kovačević, gostujući na Federalnoj televiziji 6. septembra negirao genocid u Srebrenici.

Kovačević je tada rekao da u potpunosti uvažava i najiskrenije žali za svim žrtvama zločina koji se dogodio u Srebrenici, ali jasno i odgovorno tvrdi da se u Srebrenici nije dogodio genocid, da zločin koji se dogodio u Srebrenici ne može biti kvalifikovan kao genocid, jer se ni na koji način ne može porediti sa zločinima genocida kakav se dogodio nad srpskim narodom u nezavisnoj državi Hrvatskoj, kakav se dogodio u Jadovnu i na mnogim drugim stratištima.

"Ne može se porediti sa zločinom genocida, odnosno holokausta, nad jevrejskim narodom, niti genocidom koju su Turci, koji je Turska sprovela nad Armenima", izjavio je Kovačević gostujući na FTV, prenosi "Oslobođenje".

On je rekao da Republika Srpska neće pristati na uvođenje verbalnog delikta u 21. vijeku i da neće pristati na to da se jedino srpskom narodu u cijelom svijetu zabranjuje pravo na slobodu mišljenja, da bude jedini narod koji će biti okarakterisan kao genocidan.

Odlazeći visoki predstavnik u BiH Valentin Incko, koji je nedavno dao ostavku, nametnuo je dopune u Krivičnom zakonu BiH kojima se zabranjuje i kažnjava "negiranje genocida i veličanje ratnih zločinaca".