Sveta Stolica priznala je brojne pozitivne plodove koji se događaju u Međugorju, ali nisu dali svoj stav o natprirodnosti fenomena koji se vezuje uz tvrdnju svjedoka da im se tamo ukazuje Djevica Marija i šalje poruke.
U dokumentu Dikasterija za nauk vjere koji je odobrio papa Franjo ne govori se o natprirodnosti, ali se priznaju brojni duhovni plodovi,
Naime, Međugorje je dobilo status "Nulla Osta" (Nihil Obstat) što znači da se dopuštaju crkvena hodočašća, ali mnoge priče povezane s ukazanjem nisu priznate.
U Noti o duhovnom iskustvu vezanom sa Međugorje koji je potpisao kardinal Viktor Manuel Fernandez, navodi se da pozitivna ocjena većine međugorskih poruka "ne podrazumijeva proglašenje direktnog natprirodnog porijekla".
Dokumentom se upozorava i na lažne proroke i navode takve poruke. Oni koji daju katastrofična predviđanja lažni su proroci.
Dikasterij na kraju potiče one koji idu u Međugorje "da prihvate kako se na hodočašće ne ide radi susreta s navodnim svjedocima ukazanja, nego radi susreta s Marijom, Kraljicom mira".
Svjedoci ukazanja godinama tvrde kako im se Djevica Marija ukazuje i šalje poruke. Papa Franjo je 2013. godine izjavio da Djevica Marija "nije šef koji bi svaki dan slao poruke. Tom prilikom nije specifično spomenuo Međugorje, ali je te iste godine tražio da Dikasterij za nauk i vjere podnese izvještaj o tamošnjim ukazanjima.